In Swinemünde kreuzt die Via Baltica die Grenze zu Deutschland und führt über Kamminke, Stadt Usedom, Greifswald, Grimmen, Rostock, Wismar, Lübeck nach Hamburg. Von der Jacobi-Kirche in Hamburg gehen die Pilgerweg zur Elbe und bis Wedel / Schulau. Dort quert die Lühe-Schulau-Fähre die Elbe. An der Lühe entlang bis Horneburg und Harsefeld geht es weiter bis Bremen. Im Bremer Dom gibt es eine Anlaufstelle für Pilgernde.

Von Bremen kommen die Pilger nach Osnabrück, Münster und Dortmund. Über Altenburg führt der Jakobsweg nach Köln und dort müssen sich Pilger für den Weg über Aachen, Lüttich, Vezelay, bzw. über die Mosel, Trier, Metz und Le Puy entscheiden.

Von Lübeck führt eine Variante über Lauenburg, Lüneburg und durch die Lüneburger Heide nach Bremen, ein Abstecher zur  Luhestadt Winsen ist möglich.

Via Baltika